More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4237 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 286 aa  569  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  81.29 
 
 		 294 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  80.27 
 
 		 294 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  76.17 
 
 		 285 aa  434  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  77.82 
 
 		 284 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  75.45 
 
 		 285 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  75 
 
 		 285 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  75 
 
 		 285 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  75.36 
 
 		 285 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  75 
 
 		 285 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  75.36 
 
 		 284 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  75.36 
 
 		 284 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  75.36 
 
 		 284 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  75.36 
 
 		 284 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  75.36 
 
 		 284 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  75.36 
 
 		 284 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  75.36 
 
 		 284 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  75.72 
 
 		 284 aa  418  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  70.61 
 
 		 324 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  70.19 
 
 		 318 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  70.23 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  68.36 
 
 		 316 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  68.36 
 
 		 316 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  68.36 
 
 		 316 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  68.36 
 
 		 316 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  68.36 
 
 		 316 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  68.36 
 
 		 316 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  65.81 
 
 		 298 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  68.36 
 
 		 316 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  65.44 
 
 		 298 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  65.44 
 
 		 298 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  67.97 
 
 		 316 aa  351  8e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  67.05 
 
 		 297 aa  349  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  66.17 
 
 		 314 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  66.17 
 
 		 314 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  66.54 
 
 		 310 aa  348  8e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  58.09 
 
 		 279 aa  316  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  57.2 
 
 		 275 aa  278  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  57.2 
 
 		 275 aa  278  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  56.93 
 
 		 285 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  53.93 
 
 		 278 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  54.51 
 
 		 278 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  56.39 
 
 		 274 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 		 295 aa  257  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 264 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 268 aa  185  9e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  34.1 
 
 		 264 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.32 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  32.43 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 267 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  32.3 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  30.35 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  31.9 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  30.35 
 
 		 260 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  29.57 
 
 		 260 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  30.74 
 
 		 265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.69 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3600  regulatory protein, IclR  31.84 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  31.4 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.13 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  32.03 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 271 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  29.2 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  32.14 
 
 		 248 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 601 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 319 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  27.76 
 
 		 261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  35.02 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  31.22 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  28.06 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  30.97 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.91 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  29.57 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  28.51 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>