More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1583 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  100 
 
 		 291 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  49.81 
 
 		 275 aa  242  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  54.55 
 
 		 274 aa  241  7.999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  51.41 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  49.04 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  49.19 
 
 		 254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  49.77 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  48.39 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04160  transcriptional regulator, IclR family  43.85 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3621  transcriptional regulator, IclR family  45.34 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1420  transcriptional regulator, IclR family  47.71 
 
 		 269 aa  179  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.956914 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30720  transcriptional regulator  48.8 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 276 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 274 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  27.27 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  30.17 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  30.17 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  30.17 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  30.17 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  30.17 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  38.42 
 
 		 251 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  30.17 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  38.42 
 
 		 251 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  30.17 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  30.17 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  34.95 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 310 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  31.5 
 
 		 260 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 324 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  37.25 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  27.24 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  27.83 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  27.83 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  27.83 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  27.83 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  27.83 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  29.73 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  29.37 
 
 		 255 aa  99.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.89 
 
 		 256 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 285 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 285 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  29.77 
 
 		 267 aa  99  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 285 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  34.83 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 285 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  32.66 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.02 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  29.1 
 
 		 251 aa  95.5  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 260 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  28.12 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  30.38 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  27.49 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  30.38 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  29.36 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 261 aa  94  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  27.78 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 286 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  27.76 
 
 		 252 aa  92.8  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>