More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4192 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 251 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 251 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  38.96 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  40.54 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  33.61 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  39.07 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  39.41 
 
 		 277 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  36.53 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  37.8 
 
 		 277 aa  111  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  41.04 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3127  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  38.42 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  39.23 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0759  transcriptional regulator, IclR family  40.44 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  39.73 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  38.42 
 
 		 291 aa  105  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  38.39 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3621  transcriptional regulator, IclR family  35.64 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  34.25 
 
 		 278 aa  101  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  33.33 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  38.5 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  34.39 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  36.27 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4941  putative IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  34.62 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  30.31 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04160  transcriptional regulator, IclR family  38.38 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  36.12 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.24 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  29.92 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.9 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  29.92 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  38.51 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5059  transcriptional regulator, IclR family  36.75 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 283 aa  96.3  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11734  transcriptional regulator  35.5 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  32.41 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 324 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  33.62 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  29.61 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  31.56 
 
 		 251 aa  95.5  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.75 
 
 		 258 aa  95.1  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4206  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 283 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  31.06 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.18 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  34.68 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2459  IclR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  29.78 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  30.7 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0217  transcriptional regulator, IclR family  36.72 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 271 aa  92.8  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.93 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 		 255 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  32.43 
 
 		 265 aa  92  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3829  transcriptional regulator, IclR family  38.71 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  35.92 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5126  transcriptional regulator, IclR family  36.7 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2092  transcriptional regulator, IclR family  34.86 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321928 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  29.28 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  32.73 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  28.24 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  35.27 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  36 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 262 aa  89.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 262 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 273 aa  89  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  32.35 
 
 		 262 aa  89  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  31 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 238 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0484  IclR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0371471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>