More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5059 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5059  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 263 aa  521  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3127  IclR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4781  transcriptional regulator, IclR family  39.11 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  37.79 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2459  IclR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0217  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  35.45 
 
 		 308 aa  105  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  32.23 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.51 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4941  putative IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  35.34 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1276  regulatory protein IclR  29.06 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  40.12 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  30.64 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 299 aa  96.3  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.7 
 
 		 257 aa  96.3  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1639  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 273 aa  95.5  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0495627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  36.45 
 
 		 249 aa  95.5  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  29.63 
 
 		 265 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  34.25 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0484  IclR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.16 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3701  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  36.79 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  33.63 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  36.79 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 252 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  35.32 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  33.86 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2434  transcriptional regulator, IclR family  35.97 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0257982  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  33.85 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 250 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  32.55 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  34.07 
 
 		 267 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1587  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  33.17 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  26.3 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  34.5 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  27.64 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2092  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 270 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  31.62 
 
 		 258 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.74 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  28.74 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  28.74 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  28.74 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  28.74 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  28.74 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  35.43 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  30.69 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  32.08 
 
 		 265 aa  85.5  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5126  transcriptional regulator, IclR family  34.8 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  28.74 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  28.09 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  32.58 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  31.22 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1534  regulatory protein, IclR  27.2 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4206  transcriptional regulator, IclR family  35.5 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  29.82 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  27.31 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  30.41 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  27.54 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5091  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  32.37 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  32.73 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  34.34 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.63 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  30.99 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  32.76 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0759  transcriptional regulator, IclR family  36.36 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>