More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5126 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5126  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 268 aa  518  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  35.29 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  35.68 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  35.54 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  36.73 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  35.41 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  35.82 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  33.48 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  33.48 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  33.48 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  33.48 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  33.48 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  33.48 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  33.48 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  34.06 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  34.7 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  35.02 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  34.3 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  33.83 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  38.03 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  34.51 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 276 aa  112  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  32.34 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  34.06 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  34.06 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  34.06 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  36.18 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  34.06 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  37.18 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  35.68 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  34.06 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  35.32 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  36.41 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  35.78 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  35.32 
 
 		 265 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  32.34 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  33 
 
 		 263 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  34.22 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  32.86 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  34.01 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5059  transcriptional regulator, IclR family  35.78 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  38.22 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  36.49 
 
 		 276 aa  105  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  32.42 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  32.55 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  33.19 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  34.33 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  36.4 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30.47 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.67 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  33.19 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  31.72 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  35.84 
 
 		 279 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  34.45 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  36.51 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  31.4 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  34.76 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  31.4 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  34.82 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  31.4 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  32.6 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  33 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  32.6 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  35.9 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  33.04 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  32.62 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3330  transcriptional regulator, IclR family  32.33 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 252 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  29 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  37.74 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  29 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  35.56 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  29 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>