More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3802 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 264 aa  515  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  61.54 
 
 		 253 aa  281  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  55 
 
 		 246 aa  239  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  51.38 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  45 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  41.95 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  43.21 
 
 		 299 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  45.19 
 
 		 276 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  43.93 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 308 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  39.32 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  41.53 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  42.5 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  37.55 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  34.07 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  38.59 
 
 		 253 aa  135  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  40.5 
 
 		 296 aa  131  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  34.54 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  40.08 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  33.66 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  40.17 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  34.84 
 
 		 258 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  39.33 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  37 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  39.11 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  34.86 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.75 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  33.79 
 
 		 255 aa  122  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  40.43 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  41.15 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  41.15 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  38.91 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  41.15 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  40.2 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  38.66 
 
 		 259 aa  118  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  33.5 
 
 		 257 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  34.8 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  32.17 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 294 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  36.53 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  37.06 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  31.54 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  41.12 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  34.74 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  32.3 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  32.3 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  32.3 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.43 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  31.54 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  32.3 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51350  transcriptional regulator protein DgoR  37.96 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  33.33 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  36.36 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  41.48 
 
 		 215 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 269 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 283 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  30.2 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  33.75 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.33 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  40.68 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  30.33 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  31.95 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  30.33 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  30.33 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  30.33 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  30.33 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  30.33 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>