More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1675 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  100 
 
 
234 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  100 
 
 
234 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  100 
 
 
234 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  97.44 
 
 
249 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  99.53 
 
 
215 aa  424  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  57.63 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  53.65 
 
 
248 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  49.79 
 
 
253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  48.51 
 
 
270 aa  204  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  48.03 
 
 
254 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1697  regulatory proteins, IclR  98.89 
 
 
90 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
279 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  41.84 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
264 aa  161  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  46.51 
 
 
266 aa  161  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  40.95 
 
 
252 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  39.57 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  39.83 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  41.38 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
238 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  35.74 
 
 
261 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  37.22 
 
 
249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  37.22 
 
 
249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  34.25 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  39.32 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
239 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  40.98 
 
 
264 aa  123  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  38.36 
 
 
253 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
258 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  35.04 
 
 
246 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
272 aa  122  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1008  regulatory proteins, IclR  56.14 
 
 
133 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0609886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  36.19 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.73 
 
 
258 aa  118  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  35.65 
 
 
299 aa  118  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  34.89 
 
 
272 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3485  IclR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
276 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4044  IclR family transcriptional regulator  37.83 
 
 
257 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.36 
 
 
256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  35.5 
 
 
247 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.99 
 
 
252 aa  108  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.32 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  31.19 
 
 
242 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  35.22 
 
 
276 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  35.27 
 
 
262 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  35.58 
 
 
255 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 
254 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  35.27 
 
 
254 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
324 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
308 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
286 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  32.5 
 
 
277 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3839  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
247 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  33.8 
 
 
268 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.06 
 
 
259 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.67 
 
 
261 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  32.49 
 
 
263 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  32.49 
 
 
263 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  32.49 
 
 
263 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
268 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
259 aa  99.8  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  35.24 
 
 
296 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  31.8 
 
 
266 aa  99.4  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
246 aa  99  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  28.96 
 
 
246 aa  99  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  29.26 
 
 
257 aa  98.6  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  32.85 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  30.67 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  32.6 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  34.86 
 
 
277 aa  96.7  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  32.74 
 
 
284 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  32.57 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  32.23 
 
 
265 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  35.9 
 
 
268 aa  96.3  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
263 aa  95.9  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
267 aa  95.9  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
267 aa  95.1  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
260 aa  95.1  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
267 aa  94.7  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 
266 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 
265 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
262 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
261 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
268 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  30.84 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 
254 aa  93.2  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0541  transcriptional regulator, IclR family  31.53 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.765211  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4088  transcriptional regulator, IclR family  32.2 
 
 
275 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.855439  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
269 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
274 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
268 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
261 aa  92.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
256 aa  92  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
270 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>