More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1652 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  502  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  47.9 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  45.31 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  42.98 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  42.31 
 
 		 253 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  45 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  41.63 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  41.03 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 324 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  42.27 
 
 		 299 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 308 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 286 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  38.14 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  38.6 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  39.25 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  42.33 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  39.17 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  41.51 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  40.4 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  40.4 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  40.4 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  35.59 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 		 254 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  35.11 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  39.59 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  40.56 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  38.4 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  34.98 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  33.18 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  33.94 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  39.56 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  33.64 
 
 		 242 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  30.3 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51350  transcriptional regulator protein DgoR  33.73 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 261 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  33.33 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  35.82 
 
 		 257 aa  115  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 279 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  29.92 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  33.78 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.51 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 275 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  34.74 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  33.97 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.53 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  111  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  34.35 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  38.36 
 
 		 269 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4121  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 267 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101535  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.72 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  34.22 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.88 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  34.72 
 
 		 296 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03724  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  31.51 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4214  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 284 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389286 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03673  hypothetical protein  35.29 
 
 		 284 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1991  regulatory proteins, IclR  39.8 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0527624  normal  0.0427076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  30.56 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  30.83 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  31.82 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  27.06 
 
 		 248 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 		 263 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>