More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15210 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  42.92 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  44.4 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  41.67 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  41.22 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  38.04 
 
 		 270 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  39.24 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  41.55 
 
 		 264 aa  148  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  43.66 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  40.73 
 
 		 248 aa  144  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  43.93 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 238 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  42.21 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  38.98 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  42.49 
 
 		 234 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  42.49 
 
 		 234 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  42.49 
 
 		 234 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  37.24 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 249 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 249 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  37.96 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  36.67 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  39.18 
 
 		 256 aa  128  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  36.44 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  37.26 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  42.29 
 
 		 215 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  30.87 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  33.77 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  35.32 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.74 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  32.92 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  35.42 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  40.74 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  34.58 
 
 		 286 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 254 aa  118  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  33.75 
 
 		 270 aa  118  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 270 aa  118  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  36.48 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 270 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  35.62 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  30.96 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  34.88 
 
 		 265 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  31.06 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2376  transcriptional regulator, IclR family  32.58 
 
 		 281 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  38.46 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  31.19 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  34.26 
 
 		 261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  34.26 
 
 		 261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  34.26 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  34.26 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  35.17 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 269 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 269 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 269 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 269 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  35.92 
 
 		 276 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  34.58 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  31.54 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  35.5 
 
 		 266 aa  111  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  35.5 
 
 		 266 aa  111  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.58 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  31.54 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  36.36 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 324 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>