More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5435 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  52.5 
 
 		 252 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  50.42 
 
 		 238 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  46.84 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  42.8 
 
 		 299 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 324 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 286 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  42.24 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  40.89 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  40.45 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  39.73 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  44.68 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  39.18 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  39.37 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  39.24 
 
 		 259 aa  135  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  40.69 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  36.73 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  40.83 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  39.64 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  36.71 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  38.82 
 
 		 253 aa  125  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  39.01 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.67 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  33.63 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 268 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  38.83 
 
 		 277 aa  121  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 269 aa  121  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  37.56 
 
 		 249 aa  121  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 257 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  37.22 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  37.22 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  37.22 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  38.26 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  36.48 
 
 		 242 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 268 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  36.63 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  39.46 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  36.52 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  36.59 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  37.05 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  37.92 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  37.56 
 
 		 215 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  30.97 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.98 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.36 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  36.16 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  36.16 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  33.49 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.8 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  36.49 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  38.39 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  35.35 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 268 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  34.23 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  31.93 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  36.99 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  33.48 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  36.84 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  30.29 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4044  IclR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  29.75 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  33.03 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  33.03 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>