More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3545 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 254 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  55.87 
 
 		 270 aa  256  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  55.02 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  56.83 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  49.4 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  50.95 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  50.26 
 
 		 234 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  50.26 
 
 		 234 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  50.26 
 
 		 234 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  46.26 
 
 		 260 aa  168  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  49.43 
 
 		 215 aa  162  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  48.26 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  41.6 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 279 aa  155  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  43.2 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 238 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  34.68 
 
 		 254 aa  138  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  39.82 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  42.34 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  40.24 
 
 		 299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  40.83 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  31.67 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  38.7 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4088  transcriptional regulator, IclR family  37.97 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.855439  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  36.5 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  40.09 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  35.83 
 
 		 267 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  39.41 
 
 		 276 aa  118  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  32.32 
 
 		 265 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  35.34 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  36.7 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  37.04 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  31.94 
 
 		 265 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 262 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  33.47 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  35.15 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  36.68 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  36.19 
 
 		 259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.88 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  33.8 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 268 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  34.16 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  34.98 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 		 268 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 271 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.51 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3485  IclR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  33.85 
 
 		 295 aa  108  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  33.79 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  32.31 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  36.7 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  34.9 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 269 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 269 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  32.88 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  31.88 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  36.4 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>