More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1993 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
264 aa  529  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  54.07 
 
 
254 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  45.53 
 
 
259 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  42.34 
 
 
270 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  49.07 
 
 
253 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  44.18 
 
 
248 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  45.5 
 
 
249 aa  171  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  40.48 
 
 
252 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  44.9 
 
 
234 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  44.9 
 
 
234 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  44.9 
 
 
234 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  38.17 
 
 
260 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  44.7 
 
 
266 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  40.67 
 
 
249 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  40.67 
 
 
249 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
238 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  43.14 
 
 
256 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  45.76 
 
 
215 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
279 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  36.28 
 
 
254 aa  139  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  33.61 
 
 
261 aa  138  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  36.84 
 
 
277 aa  135  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  36.36 
 
 
255 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  40.5 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  37.9 
 
 
252 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  42.16 
 
 
253 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  37.67 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  36.12 
 
 
266 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
269 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
269 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  41.71 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  38.5 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  37 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
269 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
270 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
270 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
269 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  37.56 
 
 
270 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
270 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
269 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
270 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
270 aa  125  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
269 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
270 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
270 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
269 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
246 aa  125  7e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  33.61 
 
 
246 aa  125  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  34.71 
 
 
272 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
267 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  36 
 
 
267 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  38.42 
 
 
256 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
262 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  35.69 
 
 
265 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  35.69 
 
 
265 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  37.9 
 
 
259 aa  122  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3839  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 
247 aa  122  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  37.1 
 
 
268 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
268 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  34.1 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  38.91 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  34.88 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  35.05 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
258 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  40.93 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.41 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  35.2 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.16 
 
 
259 aa  116  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 
259 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  35.53 
 
 
280 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  32.35 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  34.41 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  38.12 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  35.25 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  36.28 
 
 
252 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  36.02 
 
 
276 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  36.02 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
324 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  39.6 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
257 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  35.51 
 
 
252 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3485  IclR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  34.01 
 
 
270 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
259 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
270 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4044  IclR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
257 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>