More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3424 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 272 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  62.7 
 
 		 284 aa  285  5.999999999999999e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  47.03 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  45.08 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  42.62 
 
 		 248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  38.52 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  39.62 
 
 		 259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  36.82 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 264 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  35.1 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  42.66 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  36.97 
 
 		 253 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  41.94 
 
 		 249 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3839  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  33.08 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  41.78 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  41.78 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  41.78 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3485  IclR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  34.38 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4044  IclR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  32.95 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  30.66 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 250 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  26.45 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  26.45 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  26.03 
 
 		 250 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  32.95 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  40.62 
 
 		 215 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  26.03 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  32.51 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  31.4 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  34.3 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 258 aa  88.6  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  27.57 
 
 		 255 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.71 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  31.17 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  35.81 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  32.91 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  27.24 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.42 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  33.49 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  34.62 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  29.32 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0687  regulatory proteins, IclR  34.33 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  30.89 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  24.81 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  27.46 
 
 		 252 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  28.51 
 
 		 254 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0542  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  34.55 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2490  IclR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3489  transcriptional regulator  29.77 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3490  IclR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1270  IclR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3452  IclR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0410  IclR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.616756  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3295  IclR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>