More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6466 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 266 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  36.02 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 276 aa  118  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2063  transcriptional regulator IclR  32.38 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0428372  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  31.51 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  35.46 
 
 		 270 aa  116  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3331  IclR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 284 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3795  IclR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433741 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.56 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  27.57 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  36.65 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0615  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.04 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 253 aa  109  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  35.55 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 292 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  30.51 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  33.65 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  31.69 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  30.53 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  31.56 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  30.93 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  29.26 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  26.97 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.36 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3441  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  33.94 
 
 		 248 aa  102  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4884  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574165  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.22 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  31.73 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.87 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.46 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  28.68 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  31.88 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  32.22 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  31.36 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  26.14 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 292 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  32.05 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  33.03 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  31.63 
 
 		 292 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  34.67 
 
 		 272 aa  99.4  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  29.15 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  34.76 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5946  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  28.85 
 
 		 265 aa  99.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  36.41 
 
 		 256 aa  99  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 272 aa  99  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>