More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4432 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 292 aa  579  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  95.21 
 
 		 292 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  86.21 
 
 		 281 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  84.72 
 
 		 300 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  84.72 
 
 		 300 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  87.08 
 
 		 295 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  88.39 
 
 		 292 aa  471  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  87.08 
 
 		 295 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  71.06 
 
 		 288 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  72.12 
 
 		 286 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  72.76 
 
 		 304 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  63.04 
 
 		 279 aa  339  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  62.22 
 
 		 279 aa  334  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  63.4 
 
 		 275 aa  334  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  56.42 
 
 		 276 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  58.44 
 
 		 272 aa  272  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  43.09 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  37.9 
 
 		 275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  36.36 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  34.06 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  36.05 
 
 		 289 aa  135  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  37.24 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  33.88 
 
 		 289 aa  128  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  29.27 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  35.63 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  31.27 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  32.17 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  31.5 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.15 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  34.89 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  32.74 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.49 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3345  regulatory protein, IclR  31.08 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2470  regulatory protein IclR  28.94 
 
 		 251 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.48 
 
 		 261 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 268 aa  99.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  24.48 
 
 		 249 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  28.57 
 
 		 251 aa  99  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  36.33 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  29.82 
 
 		 253 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 249 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 249 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.13 
 
 		 256 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  25.31 
 
 		 249 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 249 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 249 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  30.74 
 
 		 241 aa  92.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  24.18 
 
 		 249 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 272 aa  89.7  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 273 aa  89.7  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  32.62 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  27.76 
 
 		 255 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.3 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  24.48 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.18 
 
 		 277 aa  85.9  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 252 aa  85.5  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  30.36 
 
 		 241 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  29.03 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3829  transcriptional regulator, IclR family  31.7 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  31.63 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8163  transcriptional regulator IclR family  29.19 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0684047  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  27.7 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  29.34 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  31.93 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  32.92 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>