More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2518 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 289 aa  570  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  37.45 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 273 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  36.84 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 295 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  36 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 295 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  35.25 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  35.02 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  34.94 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  36.6 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  35.27 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  33.86 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  35.02 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 292 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  34.43 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  34.48 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  32.82 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  33.47 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  34.26 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 272 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  35.43 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  30.13 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  34.3 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  31.15 
 
 		 255 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  26.1 
 
 		 255 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  29.81 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  29.81 
 
 		 285 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0258  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 259 aa  92.4  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  34.19 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 268 aa  89.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5383  IclR family transcriptional regulator family  33.87 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0796  IclR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 268 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  28.91 
 
 		 295 aa  85.5  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.19 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  28.09 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4464  regulatory protein, IclR  30.77 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  24.18 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  27 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 249 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1991  regulatory proteins, IclR  28.91 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0527624  normal  0.0427076 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  29.21 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  23.36 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  23.36 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  23.36 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1175  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1270  IclR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3490  IclR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2490  IclR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3452  IclR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3489  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 350 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  28.3 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0410  IclR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.616756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3295  IclR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  27.03 
 
 		 266 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0134  IclR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102301  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  28.21 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  26.22 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2768  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  26.22 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0585  IclR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  0.0114736 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  28.39 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.22 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  26.22 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.22 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0617  IclR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.22 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2216  regulatory proteins, IclR  34.18 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108456  normal  0.474426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>