More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4464 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4464  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 247 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1720  IclR family transcriptional regulator  71.67 
 
 		 310 aa  328  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.078554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2216  regulatory proteins, IclR  41.15 
 
 		 250 aa  158  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108456  normal  0.474426 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  39.32 
 
 		 255 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  33.91 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  35.17 
 
 		 282 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  27.63 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  30.43 
 
 		 275 aa  85.9  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  30.77 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  39.63 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  30.32 
 
 		 279 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  29.41 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  29.91 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  26.86 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 286 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  27.2 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  29.74 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  27.75 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3614  transcriptional regulator, IclR family  29.88 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.149687  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02910  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  29.69 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  25.31 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  32.77 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  23.64 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0296  IclR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  27.46 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.54 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  31.06 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.56 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4884  transcriptional regulator, IclR family  29.56 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574165  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  25 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  25 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  25 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  25 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  25 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  27.56 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  24.15 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  23.81 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  23.81 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  25.42 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  23.81 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  23.81 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  21.62 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  23.81 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  23 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  23.81 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  22.92 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  26.56 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  30.73 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  32.77 
 
 		 276 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  31.8 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  27 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2705  regulatory proteins, IclR  25.69 
 
 		 284 aa  52.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  32.03 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  23.81 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0480  IclR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  23.59 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 285 aa  52.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  22.13 
 
 		 271 aa  52  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>