More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4894 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 253 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 302 aa  271  8.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  54.58 
 
 		 263 aa  260  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  37.85 
 
 		 281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  37.75 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 277 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  41.37 
 
 		 302 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 280 aa  158  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  39.57 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  42.11 
 
 		 279 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  37.7 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  33.62 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  32.93 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  33.78 
 
 		 286 aa  118  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 288 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  33.93 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 300 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  33.06 
 
 		 275 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 300 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  32.92 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  32.61 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 304 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 281 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 272 aa  101  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  32.67 
 
 		 273 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  28.63 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 292 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  29.82 
 
 		 292 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  28.46 
 
 		 276 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  28 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  26.83 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  26.12 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  25.82 
 
 		 276 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.74 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.88 
 
 		 295 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 283 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  26.94 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28.33 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  26.94 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  26.69 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  26.94 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  31.7 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  25.41 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  30.09 
 
 		 275 aa  89.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  29.02 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 249 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  30.3 
 
 		 254 aa  89  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  26.02 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  26.02 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  26.02 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  26.02 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  26.02 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  26.02 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  26.02 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  26.02 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  27.06 
 
 		 280 aa  88.6  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 260 aa  89  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  32.16 
 
 		 254 aa  88.6  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 271 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  29.46 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.86 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  25.4 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  25.81 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  25.61 
 
 		 274 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  25.61 
 
 		 274 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  25.61 
 
 		 274 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  25.61 
 
 		 274 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  25.61 
 
 		 274 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  28.7 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  26.42 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  30.43 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  31.28 
 
 		 285 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.38 
 
 		 259 aa  85.5  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>