More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2369 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  39.18 
 
 		 281 aa  178  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  35.77 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  36.71 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  36.32 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  39.84 
 
 		 302 aa  152  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  35.22 
 
 		 290 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  36.82 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  35.8 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  34.31 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  32.64 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  39.67 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  36.24 
 
 		 279 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 288 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  35 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 295 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 273 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  30.89 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 270 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 281 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 275 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  34.5 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  34.53 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  32.34 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  32.92 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  34.86 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  30.56 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 283 aa  105  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  32.54 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  35.19 
 
 		 259 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  28.74 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5383  IclR family transcriptional regulator family  34.29 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 280 aa  89.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 249 aa  89.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 249 aa  89  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  23.98 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  23.77 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4406  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  23.36 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  32.19 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  28.69 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8163  transcriptional regulator IclR family  35.32 
 
 		 249 aa  85.9  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0684047  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  29.53 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0652  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1774  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227269  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0811  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.47 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  23.08 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  29.65 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  23.17 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2470  regulatory protein IclR  31.71 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2384  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0796  IclR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  21.49 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  27.43 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1095  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 246 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  26.1 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  26.1 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  26.1 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  26.1 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  26.1 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  26.1 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  26.1 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  26.1 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2216  regulatory proteins, IclR  34.94 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108456  normal  0.474426 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  27.2 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  25.1 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1171  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>