More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4281 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  538  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  81.97 
 
 		 270 aa  384  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  47.14 
 
 		 231 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  39.84 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  39.84 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  41.49 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 243 aa  165  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 272 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 249 aa  152  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  37.4 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  34.91 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 234 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  37 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 236 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  32.67 
 
 		 334 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 251 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  36 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  35.53 
 
 		 236 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  35.53 
 
 		 236 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  28.29 
 
 		 277 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  35.95 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 228 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  35.65 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  34.27 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  34.27 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  34.84 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  35.21 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  35.47 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  35.04 
 
 		 239 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  34.6 
 
 		 244 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  33.77 
 
 		 232 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 235 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.29 
 
 		 275 aa  95.5  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  34.27 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.41 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  32.91 
 
 		 238 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  33.76 
 
 		 239 aa  94  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  35.24 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  23.29 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  34.19 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  32.53 
 
 		 273 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 220 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 239 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  23.87 
 
 		 250 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  33.97 
 
 		 233 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  34.83 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  32.91 
 
 		 240 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  26.53 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  33.76 
 
 		 239 aa  89.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  24.03 
 
 		 261 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  23.69 
 
 		 254 aa  89  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  27.04 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  27.04 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  27.04 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  27.04 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  27.04 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  27.04 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 258 aa  88.6  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  27.04 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  27.04 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  26.16 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  26.98 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  33.91 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  35.81 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  25.47 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  25.19 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 239 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>