More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6631 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 281 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  86.21 
 
 		 292 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  89.3 
 
 		 292 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  82.58 
 
 		 300 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  82.58 
 
 		 300 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  82.51 
 
 		 295 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  82.51 
 
 		 295 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  82.2 
 
 		 292 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  71.22 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  72.69 
 
 		 286 aa  397  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  70.63 
 
 		 304 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  62.36 
 
 		 279 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  63.71 
 
 		 275 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  63.42 
 
 		 279 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  53.28 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  56.79 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  42.51 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  38.31 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  37.05 
 
 		 266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  36.73 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  38.08 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  32.49 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  33.47 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  36.67 
 
 		 285 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  27.71 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  30.5 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  31.74 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  36.22 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  27.05 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  31.17 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  31.14 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  34.89 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  27.87 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  29.37 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  28.28 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2470  regulatory protein IclR  28.94 
 
 		 251 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 249 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  29.39 
 
 		 251 aa  99  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 261 aa  95.9  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3345  regulatory protein, IclR  28.4 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.95 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  26.64 
 
 		 250 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  31.34 
 
 		 254 aa  92.8  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 272 aa  92  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8163  transcriptional regulator IclR family  29.73 
 
 		 249 aa  89.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0684047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  28.1 
 
 		 287 aa  89  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 275 aa  89  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 246 aa  89  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  27.87 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  32.24 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  27.87 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3829  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 264 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  26.09 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  30.17 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.11 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 255 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 255 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 255 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  31.64 
 
 		 279 aa  85.5  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  30.32 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  28.75 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  30 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  23.67 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  24.18 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>