More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3542 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 295 aa  584  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  99.66 
 
 		 295 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  95.65 
 
 		 300 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  95.65 
 
 		 300 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  93.9 
 
 		 292 aa  530  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  87.08 
 
 		 292 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  85.71 
 
 		 292 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  82.51 
 
 		 281 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  72.1 
 
 		 304 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  74.9 
 
 		 286 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  68.14 
 
 		 288 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  63.47 
 
 		 275 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  62.96 
 
 		 279 aa  335  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  64.59 
 
 		 279 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  53.11 
 
 		 276 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 272 aa  265  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  42.28 
 
 		 271 aa  198  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  35.71 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  35.14 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  38.21 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  35.02 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  36.82 
 
 		 285 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  37 
 
 		 257 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  33.21 
 
 		 281 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  36.05 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  33.61 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  31.91 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  26.75 
 
 		 255 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  32.89 
 
 		 253 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  36.44 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  33.2 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  35.32 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3345  regulatory protein, IclR  31.85 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  31.56 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  30.31 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 249 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2470  regulatory protein IclR  28.51 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.02 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 249 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 249 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  25.51 
 
 		 249 aa  99  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.82 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  25.71 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.43 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  24.8 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  31.98 
 
 		 241 aa  95.9  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  33.03 
 
 		 266 aa  92.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 279 aa  92.4  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 259 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  25.82 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3829  transcriptional regulator, IclR family  35 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 255 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 246 aa  89.7  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  30.36 
 
 		 241 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 255 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 255 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  25.3 
 
 		 246 aa  89.7  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  24.69 
 
 		 250 aa  89.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  32.19 
 
 		 272 aa  89  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28.98 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  32.03 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 550 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.44 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  29.06 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 291 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  27.44 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  29.22 
 
 		 254 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>