More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3948 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  578  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  80.23 
 
 		 286 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  76.34 
 
 		 304 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  71.22 
 
 		 281 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  69.07 
 
 		 295 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  71.06 
 
 		 292 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  68.14 
 
 		 295 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  70.82 
 
 		 300 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  70.82 
 
 		 300 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  72.93 
 
 		 292 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  74.03 
 
 		 292 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  65.34 
 
 		 279 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  65.68 
 
 		 275 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  66.42 
 
 		 279 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  55.68 
 
 		 276 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  60.58 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  43.14 
 
 		 271 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  39.43 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 273 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  36.74 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  34.92 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  36.95 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  37.19 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  35.43 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  35.25 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 280 aa  128  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  36.94 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 261 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 277 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  36.95 
 
 		 302 aa  118  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  32.61 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  28.45 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  33.47 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  34.36 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  32 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 249 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  28.16 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 		 259 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  28.16 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  27.76 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.99 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3345  regulatory protein, IclR  30.53 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  32.6 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  29.39 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  29.22 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2470  regulatory protein IclR  30.17 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.67 
 
 		 256 aa  99.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 255 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 255 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 255 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  25.91 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  31.33 
 
 		 241 aa  97.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 257 aa  95.9  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 246 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  32.5 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  26.56 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  27.27 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 283 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  32.94 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3829  transcriptional regulator, IclR family  32.38 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  29.3 
 
 		 249 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  28.52 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 287 aa  89.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  29.39 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  31.22 
 
 		 242 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  25.91 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  29.68 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.78 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  26.69 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 252 aa  85.9  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 284 aa  85.9  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 291 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  29.8 
 
 		 251 aa  85.9  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>