More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5934 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 266 aa  523  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  64.66 
 
 		 275 aa  314  7e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  60.16 
 
 		 269 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  35.96 
 
 		 279 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  34.23 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  35.83 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  33.72 
 
 		 276 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 281 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 300 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 300 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  36.36 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  36.6 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  33.98 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 257 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  32.44 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 280 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  30.95 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  30.16 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  30.43 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  35.52 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  29.53 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  33.92 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  34.73 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  28.34 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  27.53 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  28.34 
 
 		 280 aa  105  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  27.94 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  34.32 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  30.95 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5383  IclR family transcriptional regulator family  33.33 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  27.13 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  29.91 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  35.09 
 
 		 253 aa  99  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  27.13 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  24.3 
 
 		 255 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  28 
 
 		 253 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  34.09 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  27.52 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 		 252 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.84 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  34.47 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  35.32 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 277 aa  92.4  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  27.52 
 
 		 263 aa  92.4  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.02 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  28.02 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  28.02 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  28.02 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  28.02 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  28.02 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  27.13 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  28.02 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  25.29 
 
 		 286 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  28.82 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  29.51 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0585  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 299 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  0.0114736 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0617  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 299 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 291 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  30.21 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0134  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 365 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 260 aa  88.6  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  32.03 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  26.83 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1175  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 350 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  26.44 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>