More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4627 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 285 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  87.37 
 
 		 285 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 301 aa  219  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  47.15 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  42.68 
 
 		 284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  35.63 
 
 		 292 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  35.19 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  33.06 
 
 		 276 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  36.2 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  34.71 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  37.73 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 		 281 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  34.32 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  31.5 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  34.55 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  38.68 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  30.2 
 
 		 289 aa  96.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3345  regulatory protein, IclR  30.91 
 
 		 269 aa  92.8  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  29.55 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  30.18 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4434  transcriptional regulator, IclR family  32.57 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0001758  normal  0.639145 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  28.75 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  27.86 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  35.15 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  29.29 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  25 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 249 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  24.07 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  23.65 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  30.33 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  30.74 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.71 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  26.2 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  30.2 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  30.43 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  23.87 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1796  IclR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  23.24 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  23.85 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  28.29 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.497587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2854  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2053  IclR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  26.36 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.2 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  31.56 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.28 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  26.51 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.83 
 
 		 569 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  29.86 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0796  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4574  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0696248  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  31.42 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  29.79 
 
 		 249 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>