More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3326 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 255 aa  503  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1130  transcriptional regulator, IclR family  38.96 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0091  transcriptional regulator, IclR family  40.74 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.05 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.74 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 283 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  28.46 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  27.67 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  27.42 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 273 aa  96.3  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  27.02 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  26.21 
 
 		 249 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  29.03 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 283 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 		 277 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  28.27 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 273 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 267 aa  92.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 275 aa  92.4  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4339  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  29.83 
 
 		 260 aa  92  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  27.94 
 
 		 254 aa  91.7  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  25.5 
 
 		 250 aa  92  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4172  transcriptional regulator, IclR family  32.2 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  28.11 
 
 		 303 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  30.73 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 249 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  25.51 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0681  regulatory proteins, IclR  34.69 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  29.6 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  24.28 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  28.17 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  26.46 
 
 		 295 aa  89.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 248 aa  89  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 252 aa  88.6  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  21.72 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  27.62 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  29.61 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  28.09 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  28.23 
 
 		 282 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  27.35 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  27.52 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  25.51 
 
 		 273 aa  85.5  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 325 aa  85.5  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  28.92 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  27.12 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  25.2 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  27.52 
 
 		 256 aa  85.1  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  27.92 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.2 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  30.7 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3950  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000408149  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  26.32 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  28.23 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  27.82 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  26.53 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  23.77 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>