More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1130 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1130  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 252 aa  497  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  38.96 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0091  transcriptional regulator, IclR family  41.5 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  35.06 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.77 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  29.76 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  27.78 
 
 		 282 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  31.54 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  32.75 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.26 
 
 		 271 aa  95.5  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  32.73 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  32.33 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  28.82 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  28.82 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.82 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.82 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  28.82 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.82 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.82 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.82 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 267 aa  92  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 260 aa  92  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  32.06 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 319 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  27 
 
 		 275 aa  88.6  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  27 
 
 		 275 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  27 
 
 		 275 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  27 
 
 		 275 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 267 aa  88.6  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 291 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3684  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  27.02 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  28.44 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4359  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.274629  normal  0.552414 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2383  transcriptional regulator, IclR family  30.58 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 264 aa  86.3  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 262 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0440  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 268 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 280 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 267 aa  85.9  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 263 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 		 279 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 		 248 aa  85.1  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 274 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 274 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0624  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.96 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  30.45 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0563  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.96 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0570  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.96 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2991  IclR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  26.38 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0565  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.96 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  33.89 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  29.54 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  35.64 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  31.65 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  27.62 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  28.46 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  25.78 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  25.78 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  25.78 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  25.78 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  25.78 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  25.78 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  25.78 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  25.78 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2369  regulatory proteins, IclR  26.43 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  27.66 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  27.66 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  34.16 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  28.83 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  29.39 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1546  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00070993  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  25.73 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  23.87 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>