More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0091 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0091  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 266 aa  521  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  40.74 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1130  transcriptional regulator, IclR family  41.5 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  32.93 
 
 		 252 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  26.02 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  30.61 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  26.04 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1785  IclR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  32.89 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  32.89 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  32.13 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  26.89 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  30.97 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  26.38 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  26.38 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.38 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.38 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.01 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.38 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  26.5 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.38 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.01 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  26.38 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  24.78 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  24.78 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  24.78 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  24.78 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  24.78 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  24.78 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  24.78 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  29.2 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  24.78 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  30.32 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  25.18 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  26.74 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  27.57 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  29.61 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  23.87 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  29 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  24.38 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  29.15 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2854  transcriptional regulator, IclR family  29.23 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  24.89 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  23.97 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  23.97 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  25.48 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  26.45 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  23.97 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  25 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  24.17 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  30.86 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  24.17 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  23.97 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  23.97 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5473  regulatory protein IclR  25.78 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  23.97 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  24.17 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  32.31 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  27.56 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  31.22 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  24.38 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  25.48 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  23.97 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  30.81 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2369  regulatory proteins, IclR  27.19 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  25 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  25.19 
 
 		 274 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 274 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>