More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2803 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  90.34 
 
 		 238 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  85.77 
 
 		 239 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  80.08 
 
 		 238 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  77.22 
 
 		 239 aa  364  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  77.22 
 
 		 246 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  76.25 
 
 		 240 aa  364  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  77.64 
 
 		 239 aa  363  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  76.79 
 
 		 240 aa  363  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  78.33 
 
 		 240 aa  361  7.0000000000000005e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  77.22 
 
 		 239 aa  359  3e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  74.15 
 
 		 244 aa  351  5e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  73.77 
 
 		 244 aa  348  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  72.69 
 
 		 239 aa  338  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  72.27 
 
 		 239 aa  337  8e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  72.88 
 
 		 238 aa  325  4.0000000000000003e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  68.7 
 
 		 266 aa  318  7e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  75.58 
 
 		 238 aa  316  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  68.67 
 
 		 258 aa  313  9.999999999999999e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  66.08 
 
 		 228 aa  264  8.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  66.08 
 
 		 228 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  62.93 
 
 		 232 aa  258  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  62.39 
 
 		 307 aa  252  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  63.93 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  56.84 
 
 		 244 aa  232  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  58.33 
 
 		 233 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 233 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  58.33 
 
 		 233 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  58.8 
 
 		 233 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  58.33 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  59.72 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  57.02 
 
 		 233 aa  224  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  57.92 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  58.8 
 
 		 233 aa  218  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  57.53 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  58.26 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  36.21 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  30.67 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 242 aa  99.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  29.79 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  34.6 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  34.98 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  35.87 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  33.59 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  35.68 
 
 		 276 aa  92  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  34.69 
 
 		 285 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  33.99 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  32.8 
 
 		 273 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02174  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.72 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1410  transcriptional regulator, IclR family  29.72 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2390  IclR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2402  IclR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02133  hypothetical protein  29.72 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1401  IclR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.509968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  34 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3389  transcriptional regulator, IclR family, C-terminal domain  28.92 
 
 		 260 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.49 
 
 		 295 aa  85.9  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  28.31 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  28.31 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  28.31 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  28.31 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  30.66 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2532  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.221562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2520  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2428  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>