More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1257 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 228 aa  438  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  98.25 
 
 		 228 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  80.18 
 
 		 232 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  66.96 
 
 		 238 aa  266  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  67.84 
 
 		 238 aa  264  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  66.08 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  63.44 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  64.76 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  63.44 
 
 		 239 aa  259  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  63.88 
 
 		 239 aa  257  9e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  63.88 
 
 		 239 aa  255  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  61.67 
 
 		 244 aa  252  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  63.44 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  63.88 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  63.51 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  64.76 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  63.03 
 
 		 233 aa  242  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  63.03 
 
 		 233 aa  242  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  63.03 
 
 		 233 aa  242  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  61.97 
 
 		 244 aa  241  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  61.57 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  61.97 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  61.97 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  62.91 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  60.71 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  63.26 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  58.15 
 
 		 266 aa  236  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  63.72 
 
 		 238 aa  235  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  63.98 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  59.03 
 
 		 239 aa  231  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 239 aa  228  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  63.05 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  59.29 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  59.21 
 
 		 307 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  59.72 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  60.75 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  36.14 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  29.38 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  35.1 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  35.05 
 
 		 264 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  35.05 
 
 		 264 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  32.13 
 
 		 273 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  29.91 
 
 		 254 aa  92  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 255 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 255 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 255 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 255 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  33.8 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 273 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  32.91 
 
 		 246 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  33.63 
 
 		 259 aa  85.9  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  34.12 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  32.2 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  34.39 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.53 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  29.75 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  32.46 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  31.75 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  29.5 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  36.41 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  36.02 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  28.06 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.86 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 269 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 269 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>