More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3984 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 270 aa  531  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  77.19 
 
 		 266 aa  394  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  45.25 
 
 		 231 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  41.42 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  41.42 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  42.99 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 249 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 249 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 249 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 249 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 249 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  34.8 
 
 		 234 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  36.45 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 236 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 236 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  33.48 
 
 		 334 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  30.66 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  28.74 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  36.02 
 
 		 240 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  34.8 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  35.68 
 
 		 239 aa  99  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  36.49 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 228 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  38.03 
 
 		 244 aa  97.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  36.97 
 
 		 238 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 259 aa  96.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  37.25 
 
 		 233 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 241 aa  95.5  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.94 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  35.1 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  37.93 
 
 		 233 aa  93.2  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  33.92 
 
 		 238 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 233 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  35.57 
 
 		 233 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  35.57 
 
 		 233 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  35.81 
 
 		 240 aa  92  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  35.55 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  24 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  36.27 
 
 		 233 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  34.12 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  35.75 
 
 		 232 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.21 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  34.12 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  27.54 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  34.5 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  24.08 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  29.25 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 220 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  34.36 
 
 		 233 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  34.06 
 
 		 239 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  27.76 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  36.41 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  26.52 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.21 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.16 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  26.44 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  33.69 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  30.89 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  29.19 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>