More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4151 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 264 aa  530  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 264 aa  530  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  65.71 
 
 		 254 aa  315  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  46.09 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  47.91 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  47.91 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 273 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 242 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 248 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  43.7 
 
 		 246 aa  178  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 243 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 249 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 249 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 249 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 249 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  41.63 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  39.83 
 
 		 334 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  37.17 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 236 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  37.93 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  37.93 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 307 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  34.6 
 
 		 233 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  34.6 
 
 		 233 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 233 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  34.1 
 
 		 240 aa  99  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  32.34 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  33.96 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 235 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  31 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  31.76 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  33.81 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  35.05 
 
 		 228 aa  93.2  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 228 aa  92.8  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  34.22 
 
 		 220 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  34.13 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  31.9 
 
 		 239 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 232 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  34.6 
 
 		 238 aa  89.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  32.86 
 
 		 246 aa  89  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 258 aa  88.6  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 239 aa  89  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  32.55 
 
 		 233 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  32.62 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  31.91 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  33.76 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  33.03 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  34.39 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  32.39 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  32.47 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  30.26 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  23.36 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1452  IclR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.378488  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  36.42 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4164  transcriptional regulator, IclR family  32.46 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000832407  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  32.55 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  27.13 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>