More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13004 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  450  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  81.55 
 
 		 233 aa  353  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  80.69 
 
 		 233 aa  347  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  80.47 
 
 		 233 aa  339  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  80.47 
 
 		 233 aa  339  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  80.47 
 
 		 233 aa  339  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  72.27 
 
 		 220 aa  299  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  74.88 
 
 		 233 aa  295  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  69.43 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  68.56 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  67.42 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  60.62 
 
 		 228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  59.29 
 
 		 232 aa  233  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  58.01 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  56.28 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  54.7 
 
 		 238 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  54.78 
 
 		 240 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  55.13 
 
 		 239 aa  211  7.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  53.85 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  52.99 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  54.27 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  57.87 
 
 		 238 aa  208  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  52.99 
 
 		 239 aa  208  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  51.08 
 
 		 266 aa  207  9e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  53.91 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  53.85 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  52.61 
 
 		 244 aa  205  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  54.67 
 
 		 244 aa  204  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  55.98 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 235 aa  203  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 239 aa  198  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  52.14 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  55.5 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  49.36 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  29.91 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 272 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 272 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 272 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  32.22 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  31.06 
 
 		 264 aa  89  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  31.06 
 
 		 264 aa  89  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  33.64 
 
 		 270 aa  89  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  30.67 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 277 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  34.39 
 
 		 270 aa  85.5  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 250 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  24.37 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  25.71 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 263 aa  81.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  25.24 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2384  IclR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  35.86 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0811  IclR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0652  IclR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  34.29 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1774  IclR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227269  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1095  IclR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470095  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1171  transcriptional regulator  28.39 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  29.96 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>