More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0160 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 244 aa  483  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  60.68 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  58.8 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  53.56 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  54.24 
 
 		 256 aa  224  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2051  IclR family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0630504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4409  transcriptional regulator, IclR family  52.32 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  43.53 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  42.24 
 
 		 242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0105  putative transcriptional regulator  34.91 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001509  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  33.94 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3795  IclR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433741 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 254 aa  91.7  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 260 aa  89.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2967  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 276 aa  88.6  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3331  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 284 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  31.91 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  31.91 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6484  IclR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6719  IclR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182238  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.22 
 
 		 255 aa  85.5  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 258 aa  85.1  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0340  IclR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  28.94 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  32.27 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.35 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  27.08 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3441  regulatory proteins, IclR  28.9 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0681  regulatory proteins, IclR  31.48 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  24.31 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1042  IclR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00956933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  27.1 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  25.48 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  29.28 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  32.24 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0615  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.9 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  28.57 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  27.49 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  25.48 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 263 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  30.59 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  27.03 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3974  transcriptional regulator, IclR family  30.14 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.482822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  31.69 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  25.48 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  25.35 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  27.85 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7431  Transcriptional regulator  26.67 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  31.51 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  26.77 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  34.13 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  28.64 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  27.57 
 
 		 251 aa  72  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.73 
 
 		 252 aa  72  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>