More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0681 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0681  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 257 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2053  IclR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.52 
 
 		 254 aa  109  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  34.63 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  37.5 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  36.97 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20720  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439734  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  32.06 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  32.06 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1171  transcriptional regulator  32.13 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2384  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 246 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0652  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0811  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1774  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227269  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1095  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470095  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.44 
 
 		 256 aa  99.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.97 
 
 		 256 aa  98.6  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  35.54 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 255 aa  95.5  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  34.06 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1507  transcriptional regulator, IclR family  32.82 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  37.31 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  35.94 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 267 aa  93.2  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 283 aa  92.8  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  36.97 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  34.25 
 
 		 258 aa  92  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  35.14 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  31.8 
 
 		 252 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  26.34 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  34.69 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  32.74 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  35.14 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  30.13 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.02 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  31.19 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1052  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 259 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  31.74 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  29.78 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  32.23 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2051  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0630504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  31.15 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  26.83 
 
 		 267 aa  85.9  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27200  transcriptional regulator  35.12 
 
 		 271 aa  85.9  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0677925  normal  0.469138 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 261 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 250 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0134  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 365 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102301  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  35.11 
 
 		 264 aa  85.5  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0617  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 299 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0585  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 299 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  0.0114736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  34.58 
 
 		 259 aa  85.1  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 		 271 aa  85.1  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  28.88 
 
 		 260 aa  85.1  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2768  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  31.94 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0542  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  33.77 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4409  transcriptional regulator, IclR family  31.46 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  31.52 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  30.96 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  29.75 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>