More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4409 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4409  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 249 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2051  IclR family transcriptional regulator  91.97 
 
 		 249 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0630504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  59.17 
 
 		 256 aa  275  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  59.41 
 
 		 256 aa  274  8e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  58.61 
 
 		 264 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  55.83 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  52.32 
 
 		 244 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  43.1 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  41.74 
 
 		 242 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0105  putative transcriptional regulator  32.91 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001509  transcriptional regulator  32.48 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  31.49 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0381  IclR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 301 aa  89.4  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4884  transcriptional regulator, IclR family  32.03 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574165  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0681  regulatory proteins, IclR  31.46 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3795  IclR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  31.71 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.42 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  29.69 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  28.17 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0340  IclR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151352  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  29.2 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  26.98 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  27.95 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  26.98 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  26.98 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  26.98 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  26.98 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  28.57 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5810  IclR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3331  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  28.26 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2967  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  28.93 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 260 aa  72  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.23 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  28.17 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  27.48 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  22.77 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  28.02 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  25.4 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  21.46 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  27.4 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  23.48 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  27.36 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1042  IclR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00956933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  28.14 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  29.88 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  30.67 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  29.07 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  27.19 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  27.63 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  27.83 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  21.51 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  30.67 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  28.32 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  28.32 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  28.9 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  25.45 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  28.9 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  26.19 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  26.19 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>