More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1042 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1042  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00956933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2967  IclR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  32.18 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  30.31 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  30.31 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  31.6 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 		 260 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  31.71 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  31.71 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  31.71 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  31.71 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  31.71 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  29.88 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  32.7 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  29.53 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.45 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  31.45 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  31.45 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  31.45 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  31.45 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  31.45 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  31.45 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  31.71 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  30.16 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  30 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  29.25 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  30.35 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  32 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 324 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  31.35 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  30.08 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  32.54 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 318 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.1 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  32 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3302  transcriptional regulator, IclR family  34.98 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  32.3 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 297 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 292 aa  99  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 298 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 298 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  33.73 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 298 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  28.06 
 
 		 257 aa  98.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  33.73 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  31.8 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  27.97 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  33.99 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 314 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 285 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 314 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 267 aa  95.5  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  30.95 
 
 		 277 aa  95.5  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  31.02 
 
 		 279 aa  95.5  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 275 aa  95.1  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 310 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  26 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>