More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2967 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2967  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1042  IclR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00956933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 		 265 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.35 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.09 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  27.57 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  26.03 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28.14 
 
 		 275 aa  99  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  26.1 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  26.43 
 
 		 252 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 268 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.12 
 
 		 280 aa  95.9  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  27.94 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  32.72 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 268 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  27.24 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  27.71 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  28.89 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  26.25 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  27.11 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  26.1 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  28.29 
 
 		 272 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  26.8 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  27.06 
 
 		 253 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.02 
 
 		 256 aa  89  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.02 
 
 		 256 aa  89  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  26.34 
 
 		 271 aa  89  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 271 aa  89  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.34 
 
 		 271 aa  89  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  26.34 
 
 		 271 aa  89  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.34 
 
 		 271 aa  89  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.34 
 
 		 271 aa  89  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  28.23 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  24.8 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 		 244 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.24 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.93 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.1 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  26.1 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  30.28 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  26.1 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  26.1 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  26.1 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 282 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  26.1 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0624  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.98 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  30.85 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0563  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.98 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0565  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.98 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  27.32 
 
 		 271 aa  86.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  26.1 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0570  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.98 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 		 269 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 256 aa  85.5  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  23.95 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6106  IclR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  25.7 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  25.7 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  23.62 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  25.7 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  25.7 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  25.7 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3302  transcriptional regulator, IclR family  30.34 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  25.59 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  25.6 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  25.58 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  25.58 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  25.68 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  25.68 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>