More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6211 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
282 aa  565  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  65.02 
 
 
269 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  53.61 
 
 
284 aa  270  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  49.44 
 
 
280 aa  262  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  53.85 
 
 
279 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  46.64 
 
 
273 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
273 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  48.09 
 
 
280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  44.19 
 
 
295 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  46.04 
 
 
276 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  46.04 
 
 
276 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  45.28 
 
 
276 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  42.8 
 
 
275 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  38.58 
 
 
265 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  34.85 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  34.85 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  34.85 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  34.85 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  34.85 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  34.85 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  34.85 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  34.85 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  35.61 
 
 
274 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  35.61 
 
 
274 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  35.61 
 
 
274 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  35.61 
 
 
274 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  35.61 
 
 
274 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  34.33 
 
 
277 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  34.35 
 
 
276 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  35.21 
 
 
277 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  38.08 
 
 
284 aa  169  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  33.59 
 
 
277 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  36.03 
 
 
279 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  39.11 
 
 
256 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  34.08 
 
 
280 aa  166  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  34.08 
 
 
280 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  34.08 
 
 
280 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0481  transcriptional regulator IclR  39.93 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
276 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  35.48 
 
 
275 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  34.9 
 
 
267 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.7 
 
 
277 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  33.87 
 
 
276 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
267 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  33.58 
 
 
271 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  33.58 
 
 
271 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  33.58 
 
 
271 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
261 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  33.58 
 
 
271 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  33.58 
 
 
271 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  33.58 
 
 
271 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  33.58 
 
 
271 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  29.27 
 
 
256 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
272 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
283 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 
261 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0563  DNA-binding transcriptional repressor AllR  34.72 
 
 
272 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0565  DNA-binding transcriptional repressor AllR  34.72 
 
 
272 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0570  DNA-binding transcriptional repressor AllR  34.72 
 
 
272 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0624  DNA-binding transcriptional repressor AllR  34.72 
 
 
272 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10241  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  32.53 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  32.53 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
260 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
260 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
262 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 
260 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
263 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.23 
 
 
268 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 
260 aa  135  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  36.05 
 
 
254 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
260 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  29.37 
 
 
260 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  34.73 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4432  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  31.96 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.86 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
283 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 
258 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  31.43 
 
 
255 aa  126  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  29.32 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
267 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 
257 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
249 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
283 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  36.59 
 
 
248 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  34.41 
 
 
261 aa  122  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 
269 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.18 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
246 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  28.92 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  29.15 
 
 
246 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>