More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3302 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3302  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3729  IclR family transcriptional regulator  78.08 
 
 		 268 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 268 aa  240  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.8 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 275 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 280 aa  112  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  32.43 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  30.29 
 
 		 251 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  30.36 
 
 		 267 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1042  IclR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00956933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  27.38 
 
 		 254 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.62 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 268 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  25.52 
 
 		 253 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 256 aa  96.3  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 275 aa  96.3  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  30.26 
 
 		 262 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  27.71 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  27.72 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  27.72 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  25.21 
 
 		 257 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  29.82 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  33.85 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 261 aa  92.4  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 269 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  28.11 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  26.45 
 
 		 250 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 265 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 284 aa  89.7  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  27.23 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  28.29 
 
 		 278 aa  89  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  26.2 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  26.2 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  26.2 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  26.2 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  26.2 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  32.05 
 
 		 241 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  26.2 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  26.2 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  26.2 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  28.92 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 249 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  24.14 
 
 		 246 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 255 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 255 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 255 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  27.53 
 
 		 269 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  23.77 
 
 		 249 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 259 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  30.18 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 260 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2967  IclR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  23.77 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  27.41 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  27.41 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  27.41 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  27.41 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  26.1 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  27.41 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  25.76 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  25.76 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  25.76 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>