More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3729 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3729  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3302  transcriptional regulator, IclR family  78.88 
 
 		 289 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 268 aa  249  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  29.58 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  34.44 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  31.23 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.75 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.17 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  31.84 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  26.86 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  29.04 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.88 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.95 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  29.92 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  25.52 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 		 259 aa  95.9  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 263 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  31.51 
 
 		 241 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  29.92 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  29.92 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 268 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1042  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00956933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  30.9 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  28.82 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  28.82 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  28.82 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  28.82 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  28.82 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  28.82 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  28.82 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  28.82 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  30.08 
 
 		 242 aa  89  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  27.24 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  31.28 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  29.69 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  27.35 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  27.94 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  29.39 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0481  transcriptional regulator IclR  33.07 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  24.58 
 
 		 252 aa  85.9  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  31.88 
 
 		 249 aa  85.5  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 262 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  29.26 
 
 		 262 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0652  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0811  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1774  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227269  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  33.67 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  26.72 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1095  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  27.64 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  28.89 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2384  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1171  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  25.51 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  27.59 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>