More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0283 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
257 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  81.18 
 
 
255 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  81.18 
 
 
255 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  81.18 
 
 
255 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  81.18 
 
 
255 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  81.18 
 
 
255 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  80.78 
 
 
255 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1095  IclR family transcriptional regulator  66.26 
 
 
246 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470095  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1774  IclR family transcriptional regulator  65.85 
 
 
246 aa  314  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227269  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0652  IclR family transcriptional regulator  65.85 
 
 
246 aa  314  7e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0811  IclR family transcriptional regulator  65.85 
 
 
246 aa  314  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2384  IclR family transcriptional regulator  65.45 
 
 
246 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1171  transcriptional regulator  65.85 
 
 
246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  44.35 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  38.87 
 
 
254 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  35.48 
 
 
256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
254 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0681  regulatory proteins, IclR  33.19 
 
 
256 aa  119  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.99 
 
 
280 aa  118  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  31.6 
 
 
275 aa  118  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
276 aa  116  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.45 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  34.94 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 
260 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  33.71 
 
 
290 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 
266 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 
266 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
260 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.75 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  30.24 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
260 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 
263 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  30.8 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.8 
 
 
263 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  30.8 
 
 
263 aa  109  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  30.8 
 
 
263 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  30.8 
 
 
263 aa  109  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
263 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  30.8 
 
 
263 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  30.8 
 
 
263 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  31.05 
 
 
251 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  31.05 
 
 
263 aa  108  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
263 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 
256 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  30.24 
 
 
263 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
265 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
263 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
283 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  30.8 
 
 
263 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
260 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
246 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  30.8 
 
 
263 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  30.8 
 
 
263 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  30.8 
 
 
263 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  30.8 
 
 
263 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 
263 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3729  IclR family transcriptional regulator  33.97 
 
 
268 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  29.84 
 
 
278 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3296  IclR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
250 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 
263 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
268 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
249 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
249 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
249 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
249 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
249 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
249 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
249 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  26.72 
 
 
246 aa  104  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
246 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.27 
 
 
259 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
261 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  30.63 
 
 
254 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  32.37 
 
 
252 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
256 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  31.8 
 
 
249 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 
257 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 
264 aa  102  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
249 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  32.93 
 
 
277 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
257 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  32.5 
 
 
279 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
250 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
249 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
255 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
267 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
272 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
269 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 
308 aa  99.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  35.02 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>