More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2653 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  541  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  99.62 
 
 		 263 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  99.62 
 
 		 263 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  89.35 
 
 		 263 aa  476  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  88.59 
 
 		 263 aa  474  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  87.45 
 
 		 263 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  85.55 
 
 		 263 aa  461  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  86.31 
 
 		 263 aa  462  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  85.55 
 
 		 263 aa  461  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  85.93 
 
 		 263 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  85.55 
 
 		 263 aa  461  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  85.55 
 
 		 263 aa  461  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  85.55 
 
 		 263 aa  461  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  85.55 
 
 		 263 aa  461  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  85.55 
 
 		 263 aa  461  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  84.41 
 
 		 263 aa  458  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  85.17 
 
 		 263 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  84.79 
 
 		 263 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  84.79 
 
 		 263 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  84.79 
 
 		 263 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  84.79 
 
 		 263 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  84.79 
 
 		 263 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  67.32 
 
 		 265 aa  355  5.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  62.26 
 
 		 290 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  61.33 
 
 		 292 aa  332  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  56.18 
 
 		 278 aa  285  7e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  39.11 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  36.4 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  40.16 
 
 		 259 aa  185  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  39.27 
 
 		 252 aa  168  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  38.06 
 
 		 252 aa  161  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  36.44 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  32.81 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  35.34 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  34.52 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  32.27 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  35.74 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 284 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  33.76 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  34.82 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.22 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 275 aa  138  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.75 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  32.09 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  37.44 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  32.75 
 
 		 260 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 260 aa  131  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  34.45 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  34.22 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  31.1 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  31.01 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  31.82 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  31.01 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  32.03 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  32.66 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  33.62 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  33.62 
 
 		 248 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3829  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  35.27 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  32 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  35.63 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  31.08 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  31.52 
 
 		 280 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  30.31 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  30.61 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  33.33 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.91 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  31.13 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>