More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3296 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3296  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  490  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  31.98 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  30.33 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  33.77 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 		 269 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0652  IclR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0811  IclR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1774  IclR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227269  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  27.49 
 
 		 246 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1095  IclR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470095  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2384  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 246 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1171  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 246 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4884  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 260 aa  85.1  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  34.85 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  34.85 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  34.85 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  34.85 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  28.23 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  30.64 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  27.65 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  27.91 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  31.2 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  28.11 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  26.36 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  33.84 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  28.91 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  31.63 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  25.52 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  25.52 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  25.86 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  34.13 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4172  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  32.83 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  25.94 
 
 		 250 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0105  putative transcriptional regulator  30.3 
 
 		 244 aa  72  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4434  transcriptional regulator, IclR family  28.84 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0001758  normal  0.639145 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  30.17 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  33.16 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  30.3 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  24.17 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  32.98 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  27.39 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>