More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4142 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  494  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  85.9 
 
 		 234 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  85.9 
 
 		 234 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 247 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 249 aa  158  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 248 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 242 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 236 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  38.84 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  38.84 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 249 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  39.91 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 236 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  40.81 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  39.91 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  38.22 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  40.36 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  36.41 
 
 		 270 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  35.84 
 
 		 334 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  32.91 
 
 		 240 aa  93.2  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1452  IclR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 196 aa  88.6  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.378488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.24 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3296  IclR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  28.39 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  30.96 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  31.9 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  30.88 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  32.72 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  31.34 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  26.53 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  29.3 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  26.53 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  26.67 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  24.44 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  30.41 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  26.64 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  30.23 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  29.95 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  27.86 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  29.95 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  23.79 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  22.22 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  30.41 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  29.3 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  21.81 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  21.81 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  29.49 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  31.46 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  27.06 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  27.06 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.63 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  30 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  30 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  28.22 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>