More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6026 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  92.77 
 
 		 236 aa  448  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  91.45 
 
 		 236 aa  440  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  91.06 
 
 		 236 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  91.49 
 
 		 236 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  81.28 
 
 		 236 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  81.28 
 
 		 236 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  68.94 
 
 		 242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  39.19 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 249 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  34.38 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  36.5 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  36.5 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 272 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 273 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 273 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 272 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 272 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  34.82 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  38.03 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  33.93 
 
 		 334 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  33.17 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 256 aa  92.4  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  32.07 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 		 244 aa  85.5  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.17 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  30.52 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  29.72 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1452  IclR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.378488  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  26.98 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  24.8 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  31.7 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  30.52 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  34.03 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  27.98 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  28.77 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 268 aa  72  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 273 aa  72  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  28.77 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  28.77 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  29.17 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  28.77 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0516  transcriptional regulator, IclR family  29.29 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4994  transcriptional regulator, IclR family  28.38 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0276676  normal  0.0169874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  29.22 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1130  transcriptional regulator, IclR family  34.07 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  24.51 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  27.83 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  28.31 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  26.29 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  26.45 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  24.07 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>