More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11090 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 239 aa  464  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  96.23 
 
 		 246 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  92.05 
 
 		 239 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  91.21 
 
 		 239 aa  431  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  89.96 
 
 		 240 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  82.28 
 
 		 244 aa  385  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  81.78 
 
 		 238 aa  381  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  78.9 
 
 		 238 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  79.32 
 
 		 240 aa  368  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  77.22 
 
 		 241 aa  364  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  75.31 
 
 		 239 aa  356  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  74.9 
 
 		 239 aa  354  5.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  75.53 
 
 		 239 aa  334  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  70.83 
 
 		 240 aa  331  5e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  71.67 
 
 		 258 aa  331  7.000000000000001e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  69.62 
 
 		 244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  73.97 
 
 		 238 aa  317  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  68.7 
 
 		 266 aa  315  5e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  68.64 
 
 		 238 aa  305  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  64.32 
 
 		 228 aa  261  8e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  63.44 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  59.91 
 
 		 232 aa  244  8e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 307 aa  238  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  55.87 
 
 		 244 aa  218  8.999999999999998e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  56.94 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  57.41 
 
 		 233 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  55.56 
 
 		 233 aa  214  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 233 aa  214  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  55.56 
 
 		 233 aa  214  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  57.87 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  54.89 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  59.36 
 
 		 235 aa  211  7.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  55.09 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  54.04 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  54.63 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  55 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  53.54 
 
 		 241 aa  195  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  34.16 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 242 aa  99.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  35.87 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 258 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 273 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 		 277 aa  89  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 273 aa  88.2  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  35.24 
 
 		 285 aa  86.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  32.64 
 
 		 259 aa  85.1  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 272 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  32.64 
 
 		 246 aa  85.1  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  33.64 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  31.76 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0091  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  34.98 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  33.92 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  32.65 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  27.88 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  26.98 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  31.52 
 
 		 266 aa  75.1  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3729  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  32.55 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  33.04 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>