More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5397 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 261 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.59 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  33.48 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  34.35 
 
 		 277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  35.94 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  35.94 
 
 		 265 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  34.74 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.6 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  35.02 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  31.7 
 
 		 270 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 270 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 270 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  34.35 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  31.72 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.77 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  33.85 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  33.33 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  32.72 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  30.88 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 273 aa  99  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 262 aa  98.6  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  30.41 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  31.19 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  30.41 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.8 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  32.72 
 
 		 286 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.19 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  31.19 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  31.19 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  31.19 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  31.19 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  31.19 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  29.95 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  31.03 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 270 aa  96.3  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 255 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 257 aa  95.9  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2376  transcriptional regulator, IclR family  31.8 
 
 		 281 aa  95.9  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 261 aa  95.5  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 269 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  30.41 
 
 		 263 aa  95.1  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  31.19 
 
 		 263 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  31.19 
 
 		 263 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  31.19 
 
 		 263 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  31.19 
 
 		 263 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  31.19 
 
 		 263 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  31.84 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  30.88 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  32.41 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0920  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 282 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687031  normal  0.0182204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  33.17 
 
 		 294 aa  93.2  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  30.73 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.7 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.23 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  30 
 
 		 280 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>