More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2133 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  40.89 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  41.18 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  40.49 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  44.5 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  38.66 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 324 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  42.8 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 286 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  40.28 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  39.15 
 
 		 276 aa  144  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  35.35 
 
 		 254 aa  145  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  35.81 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  35.59 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  35 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  33.98 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  37.55 
 
 		 242 aa  138  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  35.59 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 238 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  39.91 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  41.21 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  35.12 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  40.55 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  41.26 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  36.78 
 
 		 264 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  37.6 
 
 		 248 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.84 
 
 		 259 aa  128  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.64 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  31.6 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  30.95 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  37 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  35.94 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  37.31 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  35.8 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  33.79 
 
 		 254 aa  125  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 263 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  34.01 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 269 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 268 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 269 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 269 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 269 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  34.93 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  33.33 
 
 		 295 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  32.27 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 292 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 		 269 aa  121  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 269 aa  121  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  35.68 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  33.33 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  36.2 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  33.48 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  34.39 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  33.48 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  33.48 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  33.48 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  36.92 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  36.92 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  36.2 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  36.92 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  36.2 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  32.68 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  33.64 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  35.29 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  31.65 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  34.85 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>