More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0547 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
265 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  89.06 
 
 
266 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  60.71 
 
 
286 aa  291  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
264 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  40.56 
 
 
255 aa  185  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
263 aa  175  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  40 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  39.18 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  33.2 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.26 
 
 
259 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
269 aa  151  8.999999999999999e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.75 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  29.8 
 
 
278 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.88 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
277 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.84 
 
 
272 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  33.8 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  38.66 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  32.33 
 
 
252 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  30.57 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  32.55 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
262 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  35.35 
 
 
248 aa  128  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  32.55 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  32.55 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  32.55 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  32.55 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  34.68 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  32.55 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.6 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  31.6 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  31.6 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  31.6 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  31.6 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  31.6 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  31.6 
 
 
263 aa  126  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  31.96 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
268 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
283 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
273 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.37 
 
 
254 aa  123  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  30.87 
 
 
257 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  31.13 
 
 
263 aa  122  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  36.77 
 
 
246 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
276 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  35.11 
 
 
258 aa  121  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  33.19 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  31.6 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  34.06 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  31.13 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
254 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.29 
 
 
258 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
258 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  34.55 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.27 
 
 
295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
260 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  32.49 
 
 
248 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
280 aa  118  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  30.74 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  33.04 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  33.04 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  33.04 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
550 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  32.59 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  29.72 
 
 
263 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.8 
 
 
265 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  33.96 
 
 
254 aa  115  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  34.05 
 
 
253 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 
299 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  30.74 
 
 
277 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  33.04 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  33.79 
 
 
249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  28.57 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  29.68 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  39.18 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  31.39 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.17 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  31.39 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  31.39 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  31.39 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  29.68 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  31.39 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  29.25 
 
 
265 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 
265 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>